O Zika vírus (ZIKV) é um arbovírus da família Flaviviridae transmitido a seres humanos principalmente através do mosquito pertencente ao gênero Aedes, incluindo a espécie Aedes aegypyti. Foi incialmente isolado em 1947 na floresta Zika na Uganda. Como todos os flavivírus, é um vírus envelopado, RNA fita única com um genoma de aproximadamente 11 kb. Sua infecção vai deste assintomática até sintomas tais como febre, mialgia, cefaleia, anorexia, mal estar, linfadenopatia e diarreia. Apresentações clínicas não específicas podem confundir com muitas outras arboviroses particularmente com infecções pelo vírus da dengue e vírus Chikungunya. Surtos mostram que a febre Zika (FZ) é uma doença emergente e, sendo assim, a necessidade de técnicas de diagnóstico sensíveis e específicas é cada vez mais uma realidade, devido ao fato de muitos casos serem diagnosticados erroneamente como infecção pelo vírus da Dengue. O diagnóstico molecular por RT-qPCR é amplamente utilizado na detecção de flavivírus por ser um método rápido, sensível e específico em amostras clínicas humanas. O teste molecular para o diagnóstico da infecção pelo Zika vírus permite a detecção do RNA viral. Acredita-se que o período de viremia é de 4 a 7 dias após o início dos sintomas, sendo mais intenso nos quatro primeiros dias. Por esta razão sugere-se a coleta de sangue até o 5º dia do aparecimento dos sintomas clínicos. O teste é indicado para a população emgeral, gestante ou não com sintomas clínicos sugestivos de infecção pelo Zika vírus no início dos sintomas.